O principal tratamento para a epilepsia masculina é a administração de medicamentos antiepilépticos. De acordo com o tipo de convulsões e a síndrome de epilepsia escolher drogas anti-epilépticas razoáveis, a selecção de drogas deve ter em conta o impacto na função sexual masculina e as hormonas sexuais, tais como fenitoína de sódio, fenobarbital, carbamazepina podem reduzir facilmente as hormonas sexuais, levando a uma diminuição da libido e impotência masculina, por isso, para os jovens doentes masculinos epilépticos deve evitar a selecção das drogas acima referidas. Novos medicamentos antiepilépticos como o valproato de sódio, lamotrigina e oxcarbazepina não afectam a função sexual dos pacientes epilépticos masculinos e podem ser aplicados com confiança. Se os pacientes masculinos com experiência de epilepsia diminuírem a função sexual, a testosterona pode ser aplicada, e a testosterona não afecta o grau de convulsões ou a frequência de convulsões em homens com epilepsia.