Qualquer cirurgia comporta algum risco. O objetivo da cirurgia pediátrica do estrabismo é corrigir a posição do olho tanto quanto possível para uma posição positiva, reduzir a posição da cabeça e abrandar a progressão do erro refrativo e da ambliopia. A cirurgia pediátrica do estrabismo, devido à tenra idade do doente, à falta de cooperação e à fraca tolerância à dor, é geralmente efectuada sob anestesia geral, o que acarreta os seus próprios riscos, como alergia anestésica, asfixia e sufocação. A cirurgia do estrabismo é geralmente uma redução muscular ou um reforço muscular dos músculos extra-oculares. A escolha dos músculos cirúrgicos específicos e da abordagem cirúrgica depende do estado de controlo da fusão do doente e da dimensão do estrabismo. Independentemente do tipo de cirurgia de estrabismo, os músculos extra-oculares são puxados durante a cirurgia. Existe um reflexo oculocardíaco no corpo humano, e puxar os músculos extra-oculares irá causar estimulação mecânica e excitação do nervo vago, resultando num abrandamento do ritmo cardíaco, o que pode levar a uma paragem cardíaca em casos graves. Durante a operação, será efectuada uma monitorização cardíaca e, se for detectado um ritmo cardíaco lento, a operação será suspensa até que o ritmo cardíaco recupere. Quando se detecta que uma criança tem estrabismo, recomenda-se que se dirija primeiro ao hospital para ser examinada por um profissional e, em seguida, decida o próximo passo do tratamento de acordo com a situação e a recomendação do médico.