Para infecções bacterianas gerais tais como Staphylococcus aureus, Streptococcus pneumoniae, ou infecções bacterianas gerais em doentes devido a outros enterococos ou enterobactérias, tais casos são considerados como sendo devidos a infecções ectópicas da flora normal causadas por patogénese após a imunidade do corpo ser demasiado baixa, e não são normalmente infecciosas para outras pessoas normais. Contudo, no caso de infecções bacterianas específicas como Bacillus anthracis e Mycobacterium tuberculosis, existe um risco de infecção de outras pessoas durante o período infeccioso, especialmente para Mycobacterium tuberculosis. Se o doente tiver tuberculose e se o micobactéria acidophilus se encontrar na expectoração, o doente é considerado um doente com tuberculose e é altamente contagioso. Tais pacientes devem ser isolados usando uma máscara quando saem, embrulhando a saliva em papel e levando-a para um local designado, e recolhendo e queimando artigos usados e necessidades diárias. Além disso, as fezes de infecções intestinais como a disenteria também são contagiosas e devem ser isoladas.