Há muitas maneiras de tratar fissuras anais, e é geralmente aceite que o tratamento conservador deve ser usado para fissuras anais precoces. Os tratamentos conservadores mais fiáveis são manter as fezes finas e macias, medicação local, dilatação anal e injecções. Para fissuras anais antigas (fissuras crónicas), deve ser utilizado tratamento cirúrgico. É geralmente aceite que a esfincterotomia interna deve ser preferida na ausência de comorbilidades graves, e a excisão de fissuras ou o enxerto cutâneo de excisão na presença de fístulas subcutâneas, papilomegalia anal e hemorróidas sentinela. Em conclusão, o princípio do tratamento das fissuras anais deve ser: aliviar a dor e promover a cura da úlcera, diferenciar entre as diferentes lesões e administrar um tratamento razoável. Quanto aos vários anúncios que se vangloriam deste instrumento e daquela alta tecnologia, todos eles são truques para enganar as pessoas, e para o dizer sem rodeios, não há diferença essencial entre tratamento cirúrgico e cirurgia, e ainda menos vantajoso do que a cirurgia.