As infecções por micoplasma e clamídia são transmitidas principalmente através do contacto sexual e são doenças sexualmente transmissíveis, que são clinicamente conhecidas como uretrite não-gonocócica. As três infecções comuns por micoplasma são Mycoplasma solium, Mycoplasma humanum e Mycoplasma genitalium. A clamídia comum é a Chlamydia trachomatis. A infecção pode ocorrer simultaneamente em ambos os parceiros e pode ser acompanhada por uma descarga uretral fina, com desconforto como a micção frequente, urgência, queimadura da uretra, ou vermelhidão e dor na uretra. É aconselhável que ambos os parceiros sejam examinados no hospital. O teste pode ser feito através de uma cultura ou esfregaço da alta, se o esfregaço revelar organismos de inclusão o diagnóstico pode ser confirmado. É também necessário tratar ambos os parceiros ao mesmo tempo e recomenda-se a azitromicina oral durante uma semana. A doxiciclina está contra-indicada e o contacto sexual entre os parceiros deve ser evitado durante o tratamento.