Por razões de segurança dos pacientes, a litotripsia de ondas de choque extracorporais é geralmente realizada em cinco etapas: Primeiro, os pacientes com pedras urinárias são submetidos a um estudo de imagem (ultra-som, radiografia abdominal, urografia e TC se necessário) sob a supervisão de um urologista ambulatorial para determinar o número, tamanho e localização das pedras e o impacto sobre a função renal, e para fazer uma avaliação preliminar sobre se a litotripsia de ondas de choque pode ser realizada. Na segunda etapa, os pacientes que passam na avaliação inicial são submetidos a testes laboratoriais (testes de rotina de sangue e urina e testes de coagulação, ECG e função renal, se necessário) para determinar se o paciente está apto a submeter-se à litotripsia por ondas de choque extracorporal; na terceira etapa, o litotripsista e o paciente que passou nas duas primeiras etapas acordam uma data para a litotripsia e são informados das precauções a tomar antes da litotripsia; na quarta etapa, o paciente e o litotripsista estão totalmente preparados para a litotripsia. O paciente e o litotripsista completam o tratamento de litotripsia de uma forma bem preparada e cooperativa. Na quinta etapa, após a litotripsia, o paciente deve ser submetido a uma revisão regular (meio mês, um mês, três meses, seis meses), durante a qual deve ser efectuada uma análise da composição das pedras se as pedras tiverem alta, e a dieta deve ser ajustada de acordo com a composição das pedras a fim de reduzir a taxa de recorrência das pedras.