A acne cística é um dos tipos mais graves de acne. Para a acne cística, são utilizados os seguintes métodos: primeiro, principalmente medicação oral retinóide, como comprimidos de gel de isotretinoína, ou cápsulas orais retinóides, um destes dois medicamentos pode ser escolhido, especialmente com comprimidos de gel de isotretinoína, mas deve ser tomado com função hepática normal. Em segundo lugar, podem ser usados anti-inflamatórios como a roxitromicina, azitromicina, doxiciclina e minociclina, mas é importante notar que a doxiciclina ou minociclina não deve ser tomada ao mesmo tempo que as cápsulas de isotretinoína, pois existe o risco de causar uma reacção pseudotumoral. Em terceiro lugar, pode ser utilizado o tratamento fotodinâmico, que é muito eficaz para a acne cística e recomenda-se que seja tratado sob a orientação de um dermatologista profissional num hospital normal.