Após o diagnóstico de epilepsia estar claro, o passo seguinte envolve medicação. Para pacientes com convulsões esparsas, 1-2 convulsões por ano e prognóstico benigno, a medicação pode ser retida. Antes da administração da medicação, é necessário pesar a eficácia e os efeitos adversos da droga para alcançar um equilíbrio óptimo para a melhor eficácia e os menores efeitos adversos. Para estudantes, crianças, e pacientes com fraco cumprimento da medicação, pode ser seleccionada uma forma de dosagem de acção prolongada, que pode ser tomada uma vez por dia ou uma vez de manhã e uma vez à noite, o que facilita a supervisão por parte dos membros da família. Os medicamentos antiepilépticos de largo espectro, tais como Depakene, Lamotrigine, Toltea, e Levetiracetam, são preferidos para mais de um tipo de convulsão e para pacientes ou para pacientes cujo tipo de convulsão ainda não esteja claro. Os medicamentos anti-epilépticos têm certos efeitos adversos, e é necessário explicar ao doente e à família que a ocorrência de atraso mental e declínio cognitivo não é exclusivamente um efeito adverso dos medicamentos anti-epilépticos. O doente deve ser informado sobre as possíveis reacções adversas, evitar reacções adversas graves, e ter um acompanhamento atempado. Também reforçar a educação sobre o cumprimento do tratamento da epilepsia e avisar os doentes de que o objectivo da medicação é controlar as convulsões, e não curar a doença primária que causa a epilepsia. Os medicamentos anti-epilépticos precisam de pelo menos 5-6 meias-vidas de medicamentos para surtirem efeito. Se as convulsões ainda ocorrerem num curto período de tempo após o início da medicação, não mudar para outros fármacos à vontade. Se o medicamento preferido não funcionar bem, é necessário mudar para outro tipo de fármaco. Não alterar a forma de dosagem à vontade durante o tratamento, não misturar medicamentos de diferentes fabricantes, não alternar entre comprimidos regulares e agentes de libertação prolongada. Quando sofrer de outras doenças, preste atenção para saber se os medicamentos combinados podem desencadear a epilepsia. Evite sempre a estimulação através de factores desencadeantes.