São efectuados testes e exames básicos pré-operatórios para ver se o paciente pode tolerar o procedimento e para verificar a imagem do paciente. É importante verificar quantos quistos estão presentes e depois escolher o tipo de anestesia, tanto local como geral, para o tratamento dos quistos maxilares. Em geral, a área é desinfectada e a gengiva é incisada com uma lâmina cirúrgica especial na área do quisto. Se o cisto estiver coberto de osso, o osso é removido e o cisto é exposto e depois raspado com uma espátula para ver que não há parede residual do cisto.