Se ocorrer dificuldade na micção após a cirurgia, é geralmente aconselhável que o paciente tome primeiro um banho de sitz quente, mergulhando a ferida anal em água quente para permitir que o esfíncter relaxe rapidamente. Se o esfíncter estiver relaxado, o problema da micção pode geralmente ser resolvido rapidamente. Se o doente for incapaz de urinar após medicação e tratamento físico, então é necessária a cateterização. Portanto, a cateterização é ainda o último passo e deve ser feita da forma mais suave possível, aplicando calor, banhos de sitz e alívio da dor. A cirurgia anal tem um impacto na micção porque a dor anal aumenta durante a cirurgia anal, especialmente no caso de fístulas anais maiores, onde os músculos anal e urinário são inervados pelo nervo sacral 3/4. A dor anal, devido à sua associação com o nervo, também altera o sistema urinário, quando a dor é aumentada e podem existir dificuldades com a micção. A melhor solução para o problema da micção é aperfeiçoar o alívio da dor para a cirurgia anal, para que a dor seja reduzida e a micção melhore. A principal causa da micção após a cirurgia anal é o espasmo anal, uma vez que o ânus é frequentemente estimulado pela cirurgia e o músculo do esfíncter entra em espasmo, o que causa tensão no paciente e também nos músculos urinários, o que também pode causar dificuldade na micção.