Os pacientes com lesões do manguito rotador, tratados cirurgicamente ou não, devem ser submetidos a reabilitação científica sob a orientação de um terapeuta de reabilitação profissional. A articulação precisa de ser imobilizada durante 4 semanas após a lesão no prazo de 6 semanas, o que resultará numa contractura dos músculos dos membros superiores. É por isso que é possível ajudar o antebraço afectado do lado saudável durante este tempo, realizando pequenos baloiços ou círculos para trás e para a frente. Seguem-se as compressas frias para ajudar a reduzir o inchaço dos tecidos moles, e depois as 2 semanas restantes para a remoção dos pontos, seguidas de exercícios de contracção deltóide para restaurar a função normal da articulação do ombro. Nas próximas 7-12 semanas, as ligaduras são removidas e é realizado o treino funcional da articulação do ombro, são realizados exercícios de contracção isométrica dos músculos, são mantidos bons hábitos e são realizados exercícios de vida diária. A última fase da lesão é 12 semanas mais tarde, quando o manguito rotador está basicamente curado e o treino de força pode ser feito de acordo com a capacidade de resistência, excepto para o exercício extenuante.