A cirurgia de epilepsia centra-se na remoção de lesões intracerebral que causam convulsões, incluindo esclerose hipocampal, tumores cerebrais, malformações cerebrovasculares (hemangiomas), lesões antigas de AVC, e malformações do desenvolvimento do cérebro. O tipo de cirurgia mais comummente realizada é a lobectomia temporal, que envolve a remoção de uma porção de tecido cerebral anormal do lobo temporal e é usada para tratar pacientes com “síndrome de epilepsia do lobo temporal medial”. Além da cirurgia para epilepsia do lóbulo temporal, o tipo de cirurgia mais comum é a cirurgia dos lobos frontal, parietal, e occipital. Para a cirurgia da epilepsia nestas áreas, é possível utilizar técnicas invasivas de EEG implantadas intracronicamente para uma localização precisa da região epiléptica de origem. Após a obtenção de dados satisfatórios de EEG intracraniano, a ressecção precisa do foco epiléptico será realizada com base nos resultados da monitorização. Para além destes procedimentos “excisionais”, quando a condição é grave e todo o hemisfério cerebral está envolvido, pode ser utilizado um procedimento para desconectar fibras entre os hemisférios bilateralmente ou estimulação nervosa vagus para aliviar a condição.