As fissuras anais podem levar a uma infecção local da fissura, se prolongadas. No caso de uma infecção local, os antibióticos são a base. Como a maioria das fissuras são causadas por E. coli ou bactérias anaeróbias, os antibióticos podem ser de largo espectro ou antibióticos anti-anaeróbios, ou ambos. Os pacientes com fissuras anais também devem prestar atenção à sua dieta, uma vez que a maioria das fissuras são causadas pela obstipação e fezes secas. Portanto, os pacientes devem comer uma dieta leve, comer mais vegetais, frutas e outros alimentos de fibras grosseiras, evitar alimentos picantes e estimulantes, manter as fezes macias e claras, desenvolver bons hábitos intestinais e tomar banhos de água quente após cada movimento intestinal.