Na maioria dos casos, os cistos glandulares cervicais são devidos a alterações fisiológicas no colo do útero, onde o epitélio escamoso substitui o epitélio colunar na zona de transição cervical e o novo epitélio escamoso cobre a boca do canal glandular cervical ou penetra mais profundamente no canal glandular, bloqueando a boca do canal glandular e causando obstrução à drenagem das secreções glandulares e à formação dos cistos. Lesão local do colo do útero ou inflamação crónica do colo do útero, que reduz os ductos glandulares, pode também levar à formação de cistos no colo do útero. Os quistos glandulares cervicais são encontrados no canal cervical, ou seja, quistos glandulares cervicais profundos, onde a anomalia não é visível na superfície do colo do útero e manifesta-se como hipertrofia cervical, que só é visível durante uma ecografia ginecológica. Os cistos cervicais superficiais são facilmente diagnosticados ao exame, vendo-se pequenas vesículas brancas-esverdeadas únicas ou múltiplas salientes da superfície do colo do útero. Os cistos miométricos normalmente não requerem tratamento e requerem apenas um rastreio cervical anual regular para a prevenção do cancro.