A diferença entre infecções bacterianas e outras infecções bacterianas é que as infecções bacterianas causam reacções inflamatórias locais tais como vermelhidão, inchaço, calor e dor, enquanto que as infecções fúngicas, para além destas reacções inflamatórias causadas por infecções bacterianas, também causam reacções alérgicas locais, que podem levar a comichão local grave quando ocorrem infecções fúngicas, e esta é a principal diferença. Além disso, em termos de medicação, as infecções bacterianas são esmagadoramente tratadas com metronidazol ou antibióticos de largo espectro para bactérias anaeróbias, o que permitirá obter resultados correspondentemente melhores. A vaginose bacteriana, por exemplo, é tratada com metronidazol e os sintomas clínicos são rapidamente aliviados, enquanto que as infecções por Candida precisam de ser tratadas com medicamentos para Candida a fim de alcançar os resultados adequados, por exemplo, a inflamação vaginal causada por Candida albicans requer tratamento com ácido dacrínico.