A SII nas mulheres grávidas é uma doença trombótica que necessita de hospitalização durante o início da doença. Tem um impacto significativo na saúde da mulher grávida e pode afetar o desenvolvimento do feto, provocando um atraso no crescimento fetal, nados-mortos e abortos espontâneos habituais. Por conseguinte, quando uma mulher grávida é diagnosticada com SII, é necessário que seja hospitalizada para observação e acompanhamento sob a supervisão de um médico para compreender o desenvolvimento do embrião. As mulheres grávidas têm de ser tratadas com anticoagulantes, como a heparina de baixo peso molecular, logo que possível após a deteção de trombofilia, com o objetivo de prevenir o tromboembolismo. Se houver uma combinação de hipertensão gestacional e diabetes mellitus gestacional, é necessária uma terapia anticoagulante juntamente com o tratamento da doença primária. Se uma mulher grávida for diagnosticada com trombofilia e necessitar de tomar medicamentos, deve fazê-lo sob a orientação de um profissional de saúde, para não afetar o desenvolvimento do embrião ao tomar os medicamentos sem autorização, e interromper a medicação atempadamente após a recuperação da doença.