A colecistite aguda e a colecistite crónica são o resultado de ataque bacteriano na vesícula biliar, edema e inflamação da parede da vesícula biliar, resultando em diminuição do fornecimento de sangue à parede e mais inflamação, aumento da absorção de ácidos biliares e lecitina pela vesícula biliar, e desequilíbrio da relação normal de ácidos biliares. A infecção bacteriana pode tornar a bílis facilmente ácida e o colesterol facilmente precipitado. A membrana mucosa da parede do cisto é eliminada devido à inflamação da vesícula biliar. A inflamação da vesícula biliar e dos canais biliares pode causar estagnação da bílis, e estes são factores importantes na formação de pedras. Se forem formados cálculos, devido à estimulação de cálculos ou pedras incrustadas no pescoço da vesícula biliar ou no canal da vesícula biliar, excreção pobre da bílis, estimulação química da parede da vesícula biliar por bílis, e muito fácil de ser infectado por bactérias, ocorre uma colecistite aguda, ou fazem ataques agudos de colecistite crónica. Em doentes com colecistite, mais de 90% são causados por pedras e 10% são colecistites não pedradas. Há também colecistite química, devido ao refluxo pancreático na vesícula biliar, com enzimas pancreáticas activas pode causar colecistite aguda. Em alguns pacientes desidratados, a colecistite aguda também pode ocorrer devido ao aumento da concentração de sais biliares. Colecistite bacteriana, tal como sepse, tuberculose, febre tifóide, bactérias de radiação e outras infecções bacterianas que causam disseminação hematogénica e colecistite bacteriana. Também pode ocorrer como resultado de trauma, cirurgia que causa volume de sangue insuficiente, vasoespasmo, fluxo sanguíneo lento, e trombose da artéria biliar resultando em necrose isquémica da parede da vesícula biliar e infecção secundária da vesícula biliar. Portanto, a colecistite está intimamente relacionada com a colelitíase e deve ser prevenida e tratada simultaneamente.