Se um cisto epidérmico é canceroso sem corte não pode ser generalizado e deve ser julgado com base na condição específica. Um cisto epidérmico é uma lesão benigna e não é uma doença grave. Se um cisto epidérmico estiver relativamente escondido, pequeno em tamanho e sem desconforto óbvio, normalmente não é cancerígeno. Para cistos epidérmicos com infecções e rupturas recorrentes, recomenda-se a excisão cirúrgica, uma vez que infecções repetidas podem formar inflamação crónica localmente, levando a aderências entre o cisto e os tecidos circundantes, desníveis locais da pele ou cicatrizes, tornando o tratamento posterior mais difícil. Existe a possibilidade de carcinogénese devido à estimulação repetida da infecção. Para pacientes com remoção cirúrgica de cistos epidermoides, é importante que a remoção seja completa para reduzir as hipóteses de recidiva após a cirurgia e que a medicação seja mudada regularmente para evitar a infecção da ferida.