A ocorrência e regressão da infecção por HPV está intimamente relacionada com o estado imunitário do corpo. A maioria das pessoas com infecção por HPV são transitórias e temporárias, ou seja, o HPV pode ser eliminado pelo próprio sistema imunitário do corpo, pelo que muitas doenças induzidas por HPV podem desaparecer espontaneamente sem tratamento. Por exemplo, verrugas comuns (verruga), verrugas planas (1-2 anos) e condiloma acuminado (10%-18%) desaparecem por si sós.