Comer molho de soja cru pode causar cancro do fígado, uma descoberta recente feita por investigadores. Acredita-se geralmente que a principal matéria-prima do molho de soja é a soja, e a soja e os seus produtos têm efeitos anticancerígenos porque são ricos em selénio e outros minerais. No entanto, vale a pena notar que o molho de soja é frequentemente contaminado durante a produção, armazenamento, transporte e venda devido a um saneamento deficiente, mesmo com bactérias patogénicas que causam infecções intestinais, e o problema será mais pronunciado no molho de soja a granel. As experiências demonstraram que o S. typhi pode sobreviver em molho de soja durante dois dias e as bactérias salinófilas podem sobreviver em molho de soja durante muito tempo. Em molho de soja nublado, precipitado e impuro, a contagem de bactérias pode ser mais de cem vezes superior ao padrão, e tal molho de soja pode causar doenças se consumido directamente sem aquecimento e esterilização. Além disso, os investigadores descobriram substâncias cancerígenas do molho de soja. Uma investigação realizada por epidemiologistas em Taiwan encontrou uma correlação directa entre o consumo de molho de soja e o cancro do fígado. Isto porque durante o processo de fermentação do molho de soja, as proteínas decompõem-se, produzindo uma grande quantidade de aminas, que na presença de nitritos, sintetizam as nitrosaminas cancerígenas. O molho de soja produzido por alguns fabricantes com processos de produção deficientes é altamente susceptível à contaminação por bolor. Portanto, do ponto de vista da prevenção de doenças, além de comprar molho de soja engarrafado de qualidade, não comprar molho de soja a granel, deve também prestar atenção a comer molho de soja o mais cozinhado possível, não comer cru.