Existem vários cistos ginecológicos, tais como cistos nucais e fibróides císticos no colo do útero, cistos funcionais nos ovários, cistos endometrióticos e síndrome dos ovários policísticos. Estes quistos não afectam normalmente a gravidez; se forem grandes, podem levar a um risco acrescido de infertilidade, aborto e nascimento prematuro. Os cistos nucais cervicais são formados principalmente quando o epitélio escamoso substitui o epitélio colunar na zona de transformação do colo do útero, bloqueando a boca dos ductos glandulares e causando obstrução à drenagem das secreções glandulares. Na grande maioria dos casos é uma alteração fisiológica do colo do útero e não requer tratamento especial. Se o cisto aumentar de tamanho e bloquear a abertura do colo do útero, os espermatozóides não podem entrar na cavidade uterina, levando à infertilidade. Os fibróides císticos são alterações císticas que ocorrem quando os miócitos se tornam necróticos e liquefeitos. Estes quistos normalmente não têm sintomas ou sinais clínicos óbvios nas suas fases iniciais e são na sua maioria detectados durante os exames ultra-sonográficos ginecológicos. Se os quistos aumentarem de tamanho, podem distorcer a cavidade uterina e reduzir a área intra-uterina, aumentando o risco de aborto espontâneo e nascimento prematuro. Os cistos ovarianos funcionais, a maioria dos quais não apresentam sintomas ou sinais óbvios, são geralmente inofensivos, não afectam a gravidez e normalmente desaparecem por si próprios sem tratamento. Se o cisto for grande (≥8cm), pode comprimir e irritar o útero, induzindo contracções e arriscando o parto prematuro. Se o cisto se torcer ou romper, dor abdominal intensa e súbita e hemorragia interna podem induzir contracções e conduzir a aborto espontâneo ou parto prematuro, ou choque materno levando à morte intra-uterina, a doente deve ser levada imediatamente ao médico para tratamento cirúrgico de emergência. Os cistos endometrióticos, vulgarmente conhecidos como cistos de coarctação, têm o nome do sangue vermelho escuro e antigo que flui do quisto quando este se rompe, como chocolate quente. Estes quistos são prejudiciais para o corpo e os pacientes sofrem frequentemente de períodos dolorosos e infertilidade, com uma taxa de infertilidade de até 40%. Os grandes celíacos, que estão em risco de torção e ruptura durante a gravidez, devem ser tratados, tanto quanto possível, antes da gravidez, tais como a colectomia laparoscópica.