Os principais sintomas clínicos dos quistos do seio maxilar são dor de cabeça, inchaço e dor no maxilar superior, desconforto à volta dos olhos, congestão nasal, descarga nasal amarela intermitente e descarga nasal clara, e num pequeno número de pacientes, dor de dentes. Uma pequena percentagem de pacientes com cistos do seio maxilar não apresenta sintomas quando são pequenos e normalmente só são detectados durante um exame físico. Quando a TAC e a rinoscopia sinusal são feitas, se for diagnosticado um cisto do seio maxilar, realiza-se uma excisão endoscópica do cisto do seio maxilar sob anestesia geral ou local. Após a excisão, o paciente é rotineiramente tratado com inalação nebulizada e terapia anti-inflamatória sintomática durante 1 semana, juntamente com oronema oral durante 2 semanas e uma revisão após 1 mês. A recorrência de cistos sinusais é rara após a cirurgia.