Cerca de 25% dos pacientes do sexo feminino com a sua primeira convulsão são observados durante a menarca Cerca de 2/3 dos pacientes do sexo feminino com epilepsia antes da menarca têm um aumento da frequência das convulsões, agravamento dos sintomas, ou novas formas de convulsões durante a menarca. As convulsões que ocorrem apenas durante ou em torno da menstruação são chamadas epilepsia menstrual, e pensa-se que um possível mecanismo esteja relacionado com alterações nos níveis hormonais femininos durante o ciclo menstrual. Em doentes com epilepsia menstrual, a frequência das convulsões diminui durante a fase de progesterona do ciclo menstrual e aumenta durante a fase menstrual. A razão para tal pode estar relacionada com o aumento da actividade do estrogénio durante a menstruação. O estrogénio afecta as convulsões principalmente através de efeitos de membrana e efeitos genéticos. O efeito de membrana é mediado por receptores de ácido gama-aminobutírico A (GABA-A) e receptores de N-metil-D-aspartato (NMDA). O aumento da actividade do estrogénio durante a menstruação ocupa locais de reconhecimento no receptor GABA-A, diminuindo assim a função inibitória mediada pelo receptor GABA-A e inibindo a síntese GABA. O estrogénio também actua sobre a excitabilidade mediada pelo receptor NMDA dos neurónios hipocampais, resultando num aumento da excitabilidade neuronal. Os efeitos genéticos afectam principalmente a expressão do gene do ácido glutâmico descarboxilase e diminuem a taxa e quantidade de subunidades receptoras GABA-A e a síntese GABA, o que leva ao aumento da emissão de descargas epilépticas em EEG e ao agravamento das convulsões menstruais em doentes com epilepsia menstrual. A progesterona (progesterona) tem um efeito inibidor sobre a epilepsia durante o ciclo menstrual, e o seu mecanismo de acção é oposto ao do estrogénio. Em conclusão, o estrogénio tem um efeito causador de convulsões, enquanto que a progesterona tem o efeito oposto. A diminuição da secreção de progesterona em torno da menstruação e a alteração da relação entre o estrogénio e a progesterona pode ser a causa da epilepsia menstrual.