Algum tipo de HPV é a principal causa do cancro do colo do útero e quase todas as mulheres serão infectadas com HPV em algum momento, mas apenas uma percentagem muito pequena desenvolverá cancro do colo do útero e o sistema imunitário da maioria das pessoas irá normalmente suprimir ou destruir o HPV. A infecção por HPV é também um factor de alto risco de cancro orofaríngeo, e está também associada ao desenvolvimento de cancros anal, vulvares, vaginais e penianos.