A dose terapêutica de 131I provoca danos directos por radiação na lesão do CDT, no tecido tiroideu residual, nos tecidos vizinhos e noutros tecidos e órgãos normais com capacidade de absorção de iodo, resultando em vários graus de reacções radioinflamatórias. Os efeitos secundários comuns a curto prazo (1-15 dias) após o Nail Clearance Treatment incluem: fadiga, inchaço do pescoço e desconforto faríngeo, boca seca e até inchaço doloroso das glândulas salivares, alteração do sentido do paladar, obstrução dos canais nasolacrimais, desconforto epigástrico e até náuseas, e danos no trato urinário. A maior parte dos sintomas acima referidos surgem no prazo de 1 a 5 dias após a terapia de metilação e, muitas vezes, desaparecem por si só sem tratamento especial. Alguns estudos demonstraram que a ingestão de rebuçados ácidos, a mastigação de pastilhas elásticas sem açúcar, a massagem das glândulas salivares ou a reidratação com líquidos durante o tratamento com 131I podem reduzir os danos causados pela radiação nas glândulas salivares. No entanto, um estudo recente prospetivo, aleatório, em dupla ocultação e controlado, referiu que a dose de radiação absorvida pelas glândulas salivares não foi significativamente alterada pela administração de vitamina C em diferentes momentos após a utilização de 131I. Beber grandes quantidades de água, urinar e tomar laxantes pode ajudar a reduzir os danos provocados pela radiação nas cavidades abdominal e pélvica, mas deve ser tido em conta o potencial para distúrbios electrolíticos. Em doentes com outras doenças crónicas comórbidas e/ou CDT avançada, o hipotiroidismo persistente associado a danos provocados pelo 131I após a eliminação da unha, o estado de doença subjacente pode agravar-se num curto período de tempo, o que deve ser observado de perto e tratado prontamente. Além disso, podem ocorrer nos doentes algumas alterações psicológicas, como tédio, ansiedade, insónia, medo, etc., a curto prazo, após o tratamento de desobstrução das unhas, o que não é um dano direto do 131I, mas tem origem em alguns factores durante a execução do tratamento (por exemplo, isolamento da proteção contra radiações, agravamento gradual do hipotiroidismo e influência de outras doenças, etc.).