O custo do procedimento de perfuração de um quisto renal depende principalmente de ser feito com a ajuda de ultra-sons Doppler a cores. Se a perfuração for feita com a ajuda de ultra-sons coloridos e o cisto for perfurado como um só, o custo aproximado é de $1500. Se o furo for feito cegamente sem ultra-som a cores, o custo aproximado é de cerca de $500. Quanto maior o número de quistos, maior o custo do furo, e estes são os honorários cobrados por um hospital terciário. Se a punção for feita num hospital de nível 2 ou nível 1, as taxas são inferiores a este nível. Além disso, se o cisto precisar de ser esclerosado com álcool anidro após a punção, então isto aumentará o custo. O custo adicional da escleroterapia com álcool anidro para um único quisto é de cerca de 200 dólares, com o custo a aumentar à medida que o número aumenta.