Se um paciente precisa de ser hospitalizado para a remoção do cisto é geralmente uma análise objectiva baseada em factores tais como a localização específica e o tamanho do cisto. Se o quisto do paciente for pequeno no tamanho e superficial no local, é menos traumático para o paciente ter o quisto removido, e o paciente recupera mais rapidamente e com menos complicações após a cirurgia. Neste caso, o paciente não precisa de ser hospitalizado e pode ter o quisto removido cirurgicamente numa clínica ambulatorial para obter melhores resultados de tratamento. Em segundo lugar, se o cisto for grande e localizado dentro de órgãos importantes como o fígado, rins ou glândula tiróide, a cirurgia para remover o cisto é mais traumática e arriscada, e é frequentemente acompanhada por uma série de complicações após a cirurgia. O paciente deve ser hospitalizado e o cisto removido sob anestesia geral na sala de operações para minimizar as complicações pós-operatórias.