O risco de cirurgia do cisto do canal sacral é de cerca de 5-10% porque é relativamente invasiva e embora a hemorragia possa ser evitada por uma série de operações microscópicas e manipulação meticulosa, existem, afinal de contas, problemas neurovasculares e ósseos envolvidos. O primeiro ponto é o problema de hemorragia após a cirurgia do cisto do canal sacral, uma vez que esta área ainda tem um fornecimento de sangue relativamente rico, e a probabilidade de hemorragia pode desenvolver-se no caso de hemostasia fraca. O segundo ponto é a infecção intracraniana, porque o líquido cefalorraquidiano está todo ligado, e se houver uma infecção neste momento, pode evoluir directamente do canal sacral para uma infecção intracraniana, por vezes com resultados irreversíveis e muito graves. O terceiro ponto é que o nervo é danificado, porque o cisto do canal sacral é principalmente um sintoma de compressão, compressão do nervo, a cirurgia a ser feita é para separar o nervo, no processo de separação pode danificar o nervo, resultando em sintomas mais graves. Por conseguinte, os quistos sacros devem ser levados a sério.