As infecções oculares podem ser bacterianas, fúngicas ou virais e devem ser tratadas com medicação anti-infecciosa, dependendo da fonte da infecção. Os medicamentos antibacterianos incluem aminoglicosídeos, tais como gentamicina, tobramicina, amikacina, etc. e quinolonas, tais como ofloxacina, levofloxacina, etc. Sulfonamidas tais como 15% de sulfacetamida de sódio, 0,1% de rifampicina, 0,2% de lincomicina, etc. Antifúngicos, tais como colírio natamicina e anfotericina B. Medicamentos antivirais tais como colírio de aciclovir, gotas oculares de ganciclovir e ribavirina são normalmente utilizados.