Em geral, a cirurgia de conização apenas remove o tecido doente da zona cervical, mas a infecção por HPV não é específica do local. Para além do local de conização cervical, outros locais não cirúrgicos também podem ser infectados, mas a probabilidade é menor. Para lesões pré-cancerosas cervicais, especialmente lesões pré-cancerosas de alto grau, CIN2 ou CIN3, a conização é geralmente o procedimento de escolha, incluindo laparotomia e conização com faca fria, qualquer das quais remove uma porção do tecido cervical. Após a remoção, o vírus HPV é removido juntamente com o epitélio da lesão cervical. Após a remoção, a maioria das mulheres não terá uma recorrência e será sempre testada negativamente para o HPV, mas em alguns casos, a doença recorrerá e o vírus HPV estará sempre presente. Há, evidentemente, algumas mulheres que têm uma recorrência da doença devido a uma nova infecção por HPV, mas isto é menos comum. Em geral, a recorrência do HPV ainda é considerada relacionada com o facto de o vírus original não ter sido completamente removido. Algumas mulheres podem ter infecção persistente por HPV ou mesmo recorrência da doença, e muito poucas mulheres podem desenvolver cancro do colo do útero. Após a conização, o HPV mais TCT deve ser verificado a cada 3-4 meses. Se o teste for negativo por 3 vezes seguidas, considera-se que está temporariamente curado, após o que deve ser verificado uma vez por ano. Durante o processo de rastreio, algumas mulheres tornam-se então HPV positivas, após o que desenvolvem gradualmente lesões pré-cancerosas cervicais, ou mesmo progridem para cancro do colo do útero se falharem a verificação posterior. Se o vírus HPV estiver presente, pode tentar livrar-se dele através do reforço do seu sistema imunitário ou usando medicação anti-HPV, e se o pré-câncer cervical se tiver desenvolvido, deverá ser tratado novamente. Em casos graves, a progressão para o cancro do colo do útero requer um tratamento agressivo com cirurgia, radioterapia e quimioterapia.