Os quistos sebáceos do couro cabeludo, se o tumor for relativamente pequeno, inferior a 1cm ou menos, sem sinais óbvios de infecção, podem ser tratados de forma conservadora sem pressão frequente na mão ou acção de compressão para reduzir a probabilidade de infecção. No caso de quistos sebáceos que ficam infectados ou formam quistos maiores, a remoção cirúrgica pode ser considerada neste caso, onde um grande quisto sebáceo pode ser excisado e uma sutura de uma fase pode ser realizada quando não há período de infecção. Se um cisto sebáceo do couro cabeludo for infectado e houver inflamação aguda, como vermelhidão, inchaço, calor e dor, a excisão sebácea de emergência do cisto pode ser considerada. Se o quisto permanecer após drenagem e cicatrização adequadas, pode ser realizada uma segunda cirurgia numa data eletiva para a excisão completa e depois uma fase de sutura. Os pacientes com cistos sebáceos no couro cabeludo são aconselhados a visitar um hospital regular para um exame detalhado e selecção de um plano de tratamento adequado.