A cirurgia do cisto hepático é geralmente designada por de-topping, que remove a parte superior do cisto hepático e permite que o líquido do cisto drene para a cavidade abdominal para atingir o objectivo de não crescer mais, pelo que a cirurgia é muito simples e geralmente minimamente invasiva. A operação é geralmente minimamente invasiva. O laparoscópio faz três orifícios, dois de 5mm e um de 10mm, de modo que o topo é removido e o líquido do cisto é aspirado, permitindo que o líquido do cisto drene para a cavidade abdominal, e a operação termina em meia hora. Contudo, em alguns pacientes, o cisto hepático encontra-se num local especial, tal como no lobo posterior direito ou no topo do diafragma, que está próximo do diafragma, e é fácil selar o orifício aberto com o diafragma após a cirurgia. Neste caso, a hepatectomia parcial ao longo da parede do cisto pode ser executada conforme apropriado, e a operação demora relativamente mais tempo, talvez 2-3 horas, mas o resultado é mais completo.