Existem dois cenários possíveis para as crises depois de a causa da epilepsia secundária ter sido eliminada. No primeiro caso, os efeitos no sistema nervoso central podem desaparecer, a função cerebral regressa gradualmente ao normal e as crises deixam de ocorrer. Por exemplo, em alguns doentes com meningoencefalite viral, o início da doença é frequentemente caracterizado por perturbações da consciência e convulsões, mas após um tratamento adequado e uma recuperação funcional, não ocorrem convulsões mesmo sem medicamentos antiepilépticos. No segundo caso, as lesões no sistema nervoso central são irreversíveis e, mesmo que a causa inicial tenha sido eliminada, o tecido cerebral danificado persiste em descargas anormais e as convulsões continuam a ocorrer de forma intermitente, sendo necessário insistir na medicação. Por conseguinte, na prática clínica, após a eliminação da causa da epilepsia secundária, o doente deve continuar a tomar os medicamentos antiepilépticos durante algum tempo, sob a orientação do médico, e deve ser vigiado de perto quanto a alterações do seu estado. Se o médico decidir que o doente é suscetível de se enquadrar na primeira categoria, pode tentar interromper a medicação. Se o doente permanecer sem crises após a interrupção da medicação, considera-se que a interrupção da medicação foi bem sucedida e pode, portanto, concluir que o doente se enquadra na primeira categoria (pode interromper a medicação). Se a interrupção falhar, ou se o médico decidir que o doente se encontra na segunda categoria, então o doente deve continuar a tomar a medicação, normalmente durante muito tempo, ou mesmo para toda a vida.