A enterite não é necessariamente tratada com enemas, mas principalmente com medicamentos orais. Como a enterite aguda mais comum, ou seja, devido a uma dieta inadequada causada por distúrbios da flora intestinal, a dor abdominal, a diarreia, o tratamento é dado principalmente aos probióticos orais pode ser melhor. Há também pacientes com enterite crónica que não apresentam sintomas clínicos e podem ser tratados sem o uso de qualquer medicação. Para pacientes com enterite crónica, recomenda-se prestar atenção à dieta, principalmente uma dieta leve, e desenvolver bons hábitos alimentares. Para doentes com doença inflamatória intestinal, como a colite ulcerosa, se os focos da úlcera ocorrerem no recto ou no cólon sigmóide, a medicação oral pode não alcançar esse segmento do intestino, pelo que o efeito da medicação oral não é satisfatório, e pode ser considerada a terapia combinada do enema. Assim, nem todas as enterite necessitam de enemas, o tratamento da enterite baseia-se principalmente na medicação oral, pode consultar um especialista para obter detalhes.