O tratamento de acupunctura para dores de cabeça baseia-se no diagnóstico e tratamento de MTC para seleccionar acupontos. Para a dor de cabeça externa, os acupontos são Baihui, He Gu, Feng Ji, Feng Fu, Qu Ji e Sun; para a febre, Da Zhi e Tian Zhu; para a dor de cabeça vascular, Head Wei e Jiao Sun; para a dor de cabeça neurológica, Feng Ji e Feng Fu; para a dor de cabeça com deficiência de sangue, Shang Qing, Blood Sea, Foot San Li e Sanyin Jiao; para a dor de cabeça com estase sanguínea, He Gu, Sanyin Jiao e também Liver Yang. Se a dor de cabeça for causada por hiperactividade do yang hepático, os pontos de acupunctura de Hanging Skull, Tai Chong e Xing Zhong são normalmente tomados.