O mecanismo de excisão do nervo pterigóides é a remoção do nervo parassimpático no nariz, o que resulta numa constrição dos vasos sanguíneos na cavidade nasal e nos seios nasais e numa redução significativa das secreções nasais e lacrimais. Após a remoção do nervo pterigóides, o edema da lâmina propria da mucosa nasal é reduzido, o epitélio é restaurado a um estado pseudo-complexo, os eosinófilos desaparecem e a desgranulação do mastócito é reduzida. Como resultado, a libertação de mediadores como a histamina, a heparina e a 5-hidroxitriptamina é reduzida e o teste de provocação alérgica pós-operatória pode ser negativo. Estes resultados são a base teórica para a utilização no tratamento da rinite alérgica, rinite vasodilatadora e pólipos nasais. A localização oculta do nervo pterigóides torna a excisão do nervo pterigóides relativamente exigente do ponto de vista técnico para o cirurgião. Tendo em conta as diferenças de equipamento e competências dos cirurgiões entre hospitais, a eficiência real pode ser maior, com a eficiência da ressecção do nervo pterigóides a atingir cerca de 80% nos hospitais de alto nível no estrangeiro. Para pacientes com rinorreia incontrolável ou intolerantes à medicação, a neurectomia pterigóides pode ser considerada. A principal complicação da neurectomia do canal pterigóides é o olho seco pós-operatório, mas estes tendem a recuperar em cerca de um mês e são, portanto, relativamente seguros.