O omeprazol é geralmente contraindicado ou evitado durante a gravidez e deve ser utilizado com precaução em mulheres a amamentar. No entanto, alguma literatura sugere que é eficaz no tratamento dos enjoos da gravidez, pelo que pode ser utilizado quando necessário, sob a supervisão de um profissional de saúde, após ponderação dos prós e contras. O omeprazol está indicado para o tratamento de úlceras gástricas, úlceras duodenais e outras doenças, e está classificado na Categoria C na classificação de segurança para utilização na gravidez (em experiências com animais, é evidente que tem efeitos secundários no feto, mas faltam provas efectivas em mulheres grávidas, pelo que só deve ser utilizado quando for evidente que os benefícios para a mulher grávida são superiores aos danos para o feto). Uma vez que o omeprazol pode atravessar a placenta, a bula do medicamento também indica claramente que está contraindicado em mulheres grávidas e deve ser utilizado com precaução em mulheres a amamentar. A maioria das mulheres no início da gravidez pode apresentar sintomas de vómitos, o que se deve principalmente ao aumento dos níveis de HCG, a alterações da função tiroideia, ao stress mental e a outros factores. Existe literatura relevante que mostra a eficácia do omeprazol e da metoclopramida no tratamento de vómitos graves e de outros sintomas de gravidez em mulheres com gravidez precoce. O médico precisa de escolher o plano de tratamento com critério clínico. Em geral, quando uma mulher grávida está a sentir desconforto digestivo, deve tentar evitar o uso de omeprazol e outros medicamentos proibidos para mulheres grávidas, e dar prioridade a tratamentos não farmacológicos, como refeições mais pequenas, suplementação de vitamina B e psicoterapia. Se o efeito do tratamento acima não for satisfatório, o médico precisa combinar com a escolha clínica e discricionária de medicamentos como o tratamento com omeprazol.