O momento do rastreio da síndrome de Down é também muito importante. O que normalmente chamamos de rastreio da síndrome de Down é feito a meio da gravidez, mas nos últimos anos também pode ser feito nas fases iniciais da gravidez. A melhor altura para fazer um teste de rastreio é entre as 11 e 14 semanas de gravidez. O principal objectivo do rastreio da síndrome de Down é de certa forma evitar o risco de estupidez fetal congénita. Os médicos recomendam o rastreio intercalar entre as 15 e 20 semanas de gravidez, sendo o melhor momento para o rastreio entre as 16 e 18 semanas. O rastreio precoce ou tardio pode afectar a exactidão dos resultados. Se o relatório do hospital identificar um risco elevado durante o processo de rastreio, o médico recomendará normalmente uma amniocentese. Se uma mulher grávida falhar o período de rastreio, não há maneira de fazer o teste e a única maneira de rastrear a síndrome de Down é submeter-se a um teste de amniocentese, que envolve a extracção de líquido amniótico. O rastreio da síndrome de Down envolve extrair o sangue da mãe de uma veia e não requer um estômago vazio ~ é necessário trazer uma ecografia precoce para verificação e também é necessário trazer uma ecografia recente