Existem alguns efeitos secundários associados ao TAC melhorado, mas são geralmente aceitáveis e não causam qualquer dano ao corpo e o corpo recupera normalmente em cerca de 1-3 dias. Os efeitos secundários do melhoramento CT são geralmente causados pelo meio de contraste. Normalmente, o contraste é excretado após algumas horas após o teste. No entanto, alguns doentes, especialmente aqueles com alergias, podem sofrer reacções alérgicas ligeiras como prurido, rubor, edema e edema laríngeo ligeiro, que normalmente demoram 1-3 dias a resolver por si próprios e não requerem tratamento especial. Portanto, os pacientes devem ser observados durante cerca de 1-2 horas após o exame CT melhorado e não devem sair até que não haja anomalias. Os doentes devem também estar conscientes de que não devem comer antes do exame e devem ser examinados com o estômago vazio. Os doentes com hipertiroidismo grave ou alergias a agentes de contraste de iodo não devem ser submetidos a TAC melhorada.