A encefalite auto-imune é uma doença inflamatória do sistema nervoso central que está principalmente associada a uma resposta auto-imune, que ocorre quando o sistema imunitário do paciente “desidentifica” o seu próprio tecido cerebral como um antígeno estranho e produz um “ataque” ao mesmo. “Os anticorpos específicos e o ataque imunitário ao tecido cerebral do próprio paciente podem ser desencadeados por uma infecção e eventualmente levar a um processo inflamatório no tecido cerebral. Os mecanismos causais são desconhecidos e, em menor grau, podem estar relacionados com factores predisponentes tais como tumores e infecções, incluindo teratomas, tumores (síndromes paraneoplásicas) e vírus do herpes simplex/Mycoplasma/Streptococcus.