A encefalite auto-imune é uma doença inflamatória do sistema nervoso central, principalmente relacionada com a resposta auto-imune, que ocorre principalmente porque o sistema imunitário do paciente “não faz distinção entre o inimigo e ele próprio” e confunde o seu próprio tecido cerebral com antigénios estranhos, criando um “ataque” específico ao seu próprio tecido cerebral. “Os anticorpos específicos e o ataque imunitário sobre o tecido cerebral podem ser induzidos pela infecção e eventualmente desencadear o processo de inflamação do tecido cerebral. O mecanismo patogénico é desconhecido e, em menor grau, pode estar relacionado com factores predisponentes tais como tumores e infecções, incluindo teratomas, tumores (síndrome paraneoplásica), e vírus do herpes simplex/micoplasma/infecções estreptocócicas.