A taxa de morbilidade e mortalidade em doentes com encefalite grave anti-N-metil-D-aspartate receptor (NMDAR) variou de 2,9% a 9,5%. A taxa de morbilidade e mortalidade em doentes com encefalite associada a anti-LGI1 foi de 6%. Diferentes tipos de anticorpos auto-imunes associados às encefalites causam diferentes locais de envolvimento do sistema nervoso central e variam na gravidade e prognóstico da doença, com uma taxa de mortalidade média aproximada de 6%.