A causa mais comum de trombocitopenia é a destruição imunitária, e em combinação com leucopenia, deve ser feita uma aspiração da medula óssea para excluir lesões da medula óssea como a síndrome mielodisplásica. Finalmente, se o diagnóstico de trombocitopenia idiopática for confirmado, serão efectuados testes para verificar a presença de infecções virais crónicas (vírus da hepatite C, vírus da hepatite B, VIH, etc.) e infecções por Helicobacter pylori, e se presentes, estas infecções terão de ser tratadas. Após estes procedimentos, as plaquetas acima de 30 (se não houver hemorragia ou infecção significativa) podem ser monitorizadas e o tratamento pode ser considerado se as plaquetas estiverem abaixo de 30.