A encefalite pode afectar a inteligência porque a encefalite pode ser acompanhada por danos neurológicos e infecções, especialmente durante o período crítico de crescimento e desenvolvimento das crianças de 0 a 2 anos, quando a função cerebral é facilmente prejudicada e tem um maior impacto na inteligência. No entanto, há muitos casos de adultos com encefalite, e é menos provável que os adultos tenham a inteligência prejudicada devido à encefalite do que as crianças pequenas.