A epilepsia é uma doença tratável e a estimativa do prognóstico da epilepsia está relacionada com muitos factores, tais como tipo de convulsão, etiologia, frequência de convulsões, idade de início, desempenho do EEG no couro cabeludo, e resposta a medicamentos antiepilépticos. Tem sido investigado que 27,1% dos casos de epilepsia são enviados espontaneamente durante mais de 5 anos. Ataques afásicos típicos: especialmente aqueles com início antes dos 10 anos de idade têm o melhor prognóstico, com taxas de remissão até 80%. O prognóstico das crises parciais é pior para as crises psicomotoras e o pior para os espasmos infantis. A esperança média de vida dos pacientes epilépticos não é curta, mas o prognóstico é pobre se se observarem certas lesões cerebrais orgânicas conhecidas, tais como tumores cerebrais, malformações cerebrais penetrantes, e atrofia cerebral. Quanto mais precoce for o início da epilepsia em crianças, pior é o prognóstico, e naquelas com início antes da idade de 1 ano, as convulsões são frequentemente difíceis de controlar e o prognóstico é pobre. A epilepsia de início tardio, sem danos orgânicos tais como tumores cerebrais, tem um melhor prognóstico. O prognóstico é melhor para aqueles cujas crises são tratadas precocemente, mais pobre para aqueles que começam o tratamento 5 anos após o início, e melhor para aqueles cujas crises são rapidamente controladas por uma única dose convencional de medicamentos antiepilépticos. Quanto maior for a frequência das convulsões, pior será o prognóstico. Um EEG normal ou quase normal no couro cabeludo é uma boa prova de prognóstico. Um EEG anormal no couro cabeludo com descargas síncronas bilaterais tem um prognóstico melhor, enquanto que uma anormalidade num hemisfério ou uma anormalidade difusa tem um prognóstico pior. As regiões temporais e frontais têm um mau prognóstico, e as ondas de pico temporal em crianças indicam um bom prognóstico. Não existe um acordo completo entre o EEG do couro cabeludo e as convulsões. A cessação da convulsão clínica com EEG anormal no couro cabeludo não é um sinal de prognóstico. A possibilidade de morte súbita em casos individuais, para os quais nenhuma causa pode ser identificada, pode ser presumida como estando relacionada com aumento súbito e grave da pressão intracraniana, insuficiência adrenal aguda ou paresia neurológica vegetativa ou perda aguda da função do tronco cerebral causando perturbações respiratórias ou da circulação sanguínea. Com o desenvolvimento da cirurgia de epilepsia, algumas epilepsia parcial complexa e epilepsia refratária que não podem ser controladas por certos fármacos melhoraram significativamente com uma gestão adequada em alguns casos, com casos sem convulsões e raramente ocorrendo entre 30% e 70%.