O mau hálito deve ser encaminhado para o Departamento de Estomatologia e Gastroenterologia. O mau hálito está associado a doenças orais, bem como a doenças digestivas, pelo que a escolha do departamento deve ser baseada nas diferentes causas. Os pacientes com gengivite, periodontite ou cárie dentária causadora de mau hálito devem dirigir-se ao departamento de estomatologia para tratamento de doenças orais. No sistema digestivo, há falta de poder gástrico e estagnação alimentar no estômago durante muito tempo. Quando os alimentos apodrecem e fermentam, produzem um mau cheiro e emitem através do esófago, o que também pode causar mau hálito. O principal objectivo da gastroenterologia no tratamento do mau hálito é restaurar a função peristáltica do estômago e facilitar a digestão dos alimentos no estômago. Também é possível que a infecção por H. pylori cause mau hálito, o qual pode ser detectado por um teste de respiração de carbono 13 ou 14.