Recomenda-se que o omeprazol seja tomado 1-2 vezes por dia, dependendo da doença a ser tratada e da condição, e a dosagem exacta e o método de administração devem estar sob a orientação de um gastroenterologista. O omeprazol é normalmente utilizado no tratamento da gastrite aguda e crónica, esofagite de refluxo e úlcera péptica, e tem o efeito de inibir a secreção do ácido gástrico. A meia-vida do medicamento é de 6-8 horas, pelo que pode ser tomado uma vez por dia para o tratamento da gastrite e da DRGE e duas vezes por dia para o tratamento de úlceras pépticas, sendo a administração intravenosa recomendada para casos graves. Alternativamente, o omeprazol pode ser tomado em combinação com bismuto e antibióticos para o tratamento da infecção por H. pylori e é normalmente tomado duas vezes por dia. O omeprazol deve ser contra-indicado em pessoas com insuficiência renal grave, alergias a ingredientes de drogas, e em bebés e crianças pequenas. Se estiver a tomar omeprazol juntamente com outros medicamentos, deve informar imediatamente o seu médico para evitar qualquer interacção entre os medicamentos.