Os sintomas das pedras nos rins dependem geralmente do tamanho da pedra, do grau de obstrução e da presença de infecção secundária. Na ausência de infecção, os cálculos inactivos no rim podem permanecer assintomáticos durante longos períodos de tempo, e nos casos em que os cálculos tenham causado insuficiência renal, podem não ser detectados por acaso nas radiografias abdominais. No entanto, a maioria dos pacientes são geralmente sintomáticos. Os principais sintomas das pedras nos rins são dor e hematúria. De acordo com as estatísticas, cerca de 75% dos doentes com cálculos renais têm dores nas costas. Quando a pedra é grande e menos móvel na pélvis renal, a dor é maioritariamente baça e por vezes vaga. Quando a pedra é pequena e tem um alto grau de mobilidade na pélvis, a dor é baça e por vezes vaga. Isto pode causar obstrução da junção ureteral da pélvis renal e resultar em cólicas renais. A cólica é um início súbito de dor intensa que normalmente começa na parte inferior das costas e irradia pelo ureter até à bexiga. A dor é geralmente paroxística, dura geralmente alguns minutos ou até várias horas, e é acompanhada de náuseas e vómitos, por vezes com caras pálidas, suadas e fracas. Outro sintoma de pedras nos rins é a hematúria, que ocorre subitamente quando há um elevado nível de actividade física, tal como excesso de trabalho, exercício excessivo, equitação e equitação de carro. Contudo, a presença de hematúria é geralmente suave e não visível a olho nu, mas em todos os casos um exame microscópico da urina é importante, uma vez que alguns a muitos glóbulos vermelhos podem ser vistos ao microscópio. Uma proporção dos doentes não tem a típica dor clínica e hematúria da doença de pedra, mas apresenta ao médico sintomas de uma infecção do tracto urinário. Neste grupo de pacientes, a presença de pedras pode ser facilmente perdida se a causa primária da infecção não for investigada e se não forem realizadas radiografias urológicas simples e urográficas intravenosas. Uma história de descarga ocasional de pedras ou pequenos grãos de areia em doentes com pedras nos rins pode ser útil para fazer um diagnóstico. Se pedras nos rins bilaterais causarem obstrução ou se o paciente tiver uma obstrução no único rim, esta pode ser seguida de anúria aguda. Por vezes uma pedra nos rins pode causar dores nas costas do lado oposto, devido ao reflexo rim-renal. A anúria aguda também pode ser causada por uma obstrução unilateral de pedra nos rins. Além disso, se uma pedra nos rins não causar hidronefrose ou infecção secundária, o exame físico pode mostrar dor de percussão na zona dos rins ou nenhuma anomalia.