Os sintomas clínicos do cancro do canal biliar estão relacionados com o seu local de ocorrência, o grau de obstrução do canal biliar, e o grau de invasão tumoral. Em geral, o colangiocarcinoma localizado no fígado, ou o tipo periférico, não apresenta sintomas especiais, frequentemente apenas sintomas ligeiros, tais como distensão abdominal, a menos que a maioria dos lóbulos hepáticos tenha sido corroída, e a icterícia raramente aparece, mas os testes bioquímicos revelam frequentemente anomalias em testes especiais da função hepática, tais como o fosfato alcalino P. Se os doentes com colangiocarcinoma periférico tiverem pedras nos canais biliares intra-hepáticos, a frequência dos sintomas pode variar, por exemplo, é mais provável que tenham infecções nos canais biliares e podem ter febre e arrepios. Alguns doentes podem ser diagnosticados acidentalmente com cancro do canal biliar depois de submetidos a cirurgia para colangite aguda. Se o colangiocarcinoma crescer na parte hilar do fígado, o chamado colangiocarcinoma hilar, e o colangiocarcinoma dos canais biliares extra-hepáticos, os sintomas comuns incluem dor abdominal, porque pode facilmente causar obstrução dos canais biliares, icterícia e comichão na pele. Estima-se que mais de 80% deste tipo de cancro do ducto biliar se apresentará com icterícia, e as fezes ficarão mais claras ou mesmo brancas. Para além das anomalias bioquímicas, as células hepáticas podem também ser afectadas por obstrução prolongada do canal biliar, e a coagulação do sangue pode ser prolongada ao longo do tempo. O cancro do canal biliar geralmente não cresce rapidamente, mas se houver dor, indica frequentemente que é bastante grave e alastrou até à fase terminal. Esta é também a razão pela qual o diagnóstico precoce do cancro do canal biliar não é fácil. Além disso, se o cancro do canal biliar ocorrer na parte superior do canal biliar, os sintomas são mais ligeiros e obscuros. Embora a icterícia e outros sintomas apareçam mais cedo nos tipos de ducto biliar hilar e extra-hepático, isto não significa que o prognóstico seja melhor.