A maloclusão não é uma doença monogénica típica, mas tem uma clara tendência a correr em família e é poligénica. O desenvolvimento dos órgãos dentários e maxilares é influenciado tanto por factores genéticos como ambientais. Em geral, a morfologia básica dos maxilares é mais governada por factores genéticos, enquanto as características dentárias são mais influenciadas por factores ambientais. Alguns tipos de má oclusão têm uma predisposição genética mais pronunciada, tais como a protrusão mandibular e a dentição aberta anterior. A genealogia da família real alemã foi estudada e verificou-se que nove gerações consecutivas tinham a má oclusão mandibular anterior presente. A genética pode determinar a forma básica do maxilar e do rosto de uma pessoa, mas muitas más oclusões não estão predestinadas a ocorrer ao nascimento, mas desenvolvem-se gradualmente em resposta a alguns factores ambientais desfavoráveis, pelo que muitas más oclusões podem ser impedidas de ocorrer ou o seu desenvolvimento interrompido.